本殿は、拝殿後ろの覆屋の中にあり縦3m、横1.5m、高さ3.6mのこぢんまりとした建築物です。
建築様式は、正面の柱間が１つで切妻屋根が前方に長く延びる「一間社流造」で江戸中期から後期にかけての一般的な様式です。
伊井大工が手掛けた現存する建物は、芦原町の春日神社本殿や福井市の願念寺本堂などがあります。

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